Il differenza principale tra motivo e dominio nella struttura proteica è che un motivo è una struttura super secondaria mentre un dominio proteico è una struttura terziaria di proteine. Inoltre, i motivi svolgono funzioni biologiche simili attraverso una particolare famiglia di proteine, mentre il dominio proteico si evolve, funziona ed esiste indipendentemente dal resto della catena proteica.

Motivo e dominio si riferiscono a tipi di componenti strutturali che possono verificarsi in una catena proteica. Inoltre, hanno importanza strutturale e funzionale nelle proteine.

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Che cos'è un motivo nella struttura delle proteine?

Un motivo è una struttura super secondaria di una proteina. Generalmente, la prima struttura 3D in evoluzione di una proteina è la struttura secondaria, che può essere un'alfa-elica o un foglio beta. Inoltre, questa struttura secondaria è formata per neutralizzare la polarità naturale di diversi amminoacidi nella struttura proteica primaria, che è una sequenza di amminoacidi. Tipicamente, questa neutralizzazione avviene attraverso la formazione di legami idrogeno. Inoltre, queste strutture secondarie si combinano tra loro per formare questi motivi. La combinazione avviene attraverso piccoli anelli.

Figura 1: motivo in fibra di zinco

Inoltre, a volte, i motivi di una particolare famiglia di proteine ​​svolgono una funzione simile. Ad esempio, il motivo in fibra di zinco svolge una funzione di legame al DNA. Alcuni altri esempi di motivi nella struttura proteica sono il motivo beta-tornante, motivo a chiave greca, motivo ad anello Omega, motivo elica-ansa-elica, motivo elica-giro-elica, motivo a nido, motivo a nicchia, ecc.

Che cos'è un dominio nella struttura proteica?

Un dominio nella struttura proteica è la struttura terziaria di una proteina. Inoltre, si forma, esiste e funziona indipendentemente dagli altri componenti della proteina. Sebbene un motivo si formi attraverso l'interazione di elementi strutturali secondari in una proteina, le interazioni che si verificano tra elementi strutturali secondari sono più forti in un dominio. Qui si possono formare diversi tipi di legami tra questi elementi strutturali secondari. Da questo, il principale tipo di legami formati sono i ponti disolfuro. Sono anche le interazioni più stabili.

Figura 2: tre domini della piruvato chinasi

Somiglianze tra motivo e dominio nella struttura proteica

Differenza tra motivo e dominio nella struttura proteica

Definizione

Un motivo nella struttura proteica si riferisce a una struttura biologica a catena costituita dalla connettività tra elementi strutturali secondari mentre un dominio nella struttura proteica si riferisce a un'unità di piegatura indipendente della struttura proteica tridimensionale. Quindi, questa è la principale differenza tra motivo e dominio.

Tipo di struttura

Un'altra differenza tra motivo e dominio è che un motivo è una struttura super secondaria di una proteina, mentre un dominio è una struttura terziaria della proteina.

Formazione

Significato

I motivi hanno principalmente una funzione strutturale nella struttura proteica, mentre i domini hanno principalmente un'importanza funzionale.

Funzione

Inoltre, i motivi hanno funzioni simili attraverso famiglie di proteine, mentre i domini hanno funzioni uniche.

Stabilità

Inoltre, i motivi non sono stabili indipendentemente, mentre i domini sono stabili indipendentemente. Quindi, questa è anche un'importante differenza tra motivo e dominio.

Conclusione

Un motivo nella struttura proteica è una struttura super secondaria di una proteina. La connettività tra alfa-eliche e foglietti beta produce motivi. Inoltre, hanno funzioni simili in una particolare famiglia di proteine. D'altra parte, un dominio è la struttura terziaria di una proteina. Significativamente, può formarsi ed esistere indipendentemente nella struttura proteica. Inoltre, ha una funzione unica nella struttura proteica. Pertanto, la principale differenza tra motivo e dominio è la struttura e l'importanza.

Riferimenti:

1. "Struttura proteica 3D: livelli strutturali, motivi e pieghe". Principi di base della struttura tridimensionale delle proteine: livelli di struttura proteica, motivi, domini e database, disponibili qui.

Cortesia dell'immagine:

1. "Zinc finger rendering" di Thomas Splettstoesser (www.scistyle.com) - autoprodotto, basato sulla struttura PDB 1A1L, lo strumento di visualizzazione molecolare open source PyMol e Cinema 4D (CC BY-SA 4.0) tramite Commons Wikimedia 2. "Domini della proteina piruvato chinasi" di Thomas Splettstoesser (www.scistyle.com) - Opera propria (CC BY-SA 3.0) tramite Commons Wikimedia